ایشان در سال ۹۸ و اوایل شیوع ویروس کرونا در پاسخ به سوالی درباره نماز جماعت در ایام کرونا "هرگونه تجمعی" را که باعث انتشار ویروس می‌شود منع نمودند. فتاوای جدید آیت الله سیستانی درباره روزه ماه رمضان با شیوع کرونادفتر آیت الله سید علی سیستانی در درگاه خود، فتاوای جدید معظم له درباره تکلیف روزه داران در ماه مبارک رمضان با وجود خطر ابتلا به کرونا را منتشر کرد.
دیدارنیوز ـ دفتر مرجعیت عالیقدر عراق نظر آیت الله العظمی سید علی سیستانی درباره روزه گرفتن ماه مبارک رمضان را با شیوع ویروس کرونا را اعلان کرد.
در متن سوالات دریافت شده توسط دفتر معظم له و پاسخ به آن‌ها آمده است:
سوال: تکلیف روزه مومنان در ماه رمضان با شیوع بیماری همه گیر کرونا چیست؟
پاسخ: مواردی وجود دارد که باید به آن‌ها توجه شود:
۱- روزه گرفتن ماه رمضان از مهمترین واجبات دینی است و ترک روزه جز با عذر واقعی که شخص به واقعی بودن آن اطمینان داشته باشد، جایز نیست.
۲- اگر شخصی برای روزه نگرفتن در ماه رمضان با پزشک مشورت کند و پزشک به او بگوید که گرفتن روزه خطر ابتلا به بیماری در او را افزایش می‌دهد و برای وی، خوف ایجاد کند روزه از او ساقط می‌شود، اما باید قضای آنرا به جا آورد. این مورد در صورتی است که او نتواند با انجام اقدامات پیشگیرانه مناسب مانند ماندن در خانه و عدم مراوده با دیگران، استفاده از ماسک و ... ترس خود را از خود دور کند. [یعنی اگر با وجود رعایت شیوه نامه‌های بهداشتی باز هم خطر ابتلا وجود داشت، می‌تواند روزه نگیرد، اما اگر شخص بتواند مثلا در خانه بماند و بدین وسیله خطر را از خود دور کند بر او لازم است روزه بگیرد]
۳- کسی که در صورت بیرون رفتن به محل کار خود - که لازم و ناچار است با دیگران مراوده داشته باشد - ترس از ابتلا به بیماری دارد، باید در ماه رمضان کار خود را ترک کند تا روزه بگیرد. اما اگر قادر به ترک کار نیست - به هر دلیل - او موظف به روزه گرفتن نیست، اما مجاز به اعلام افطار در انظار عمومی هم نیست و شخص موظف است قضای روزه اش را به جای آورد.
حضرت آیت الله سیستانی چندی پیش درباره واکسن کرونا نیز اعلام کرده بودند باید در این باره به متخصصان مورد اطمینان مربوطه، اعتماد و مراجعه شود.
همچنین ایشان در سال ۹۸ و اوایل شیوع ویروس کرونا در پاسخ به سوالی درباره نماز جماعت در ایام کرونا "هرگونه تجمعی" را که باعث انتشار ویروس می‌شود منع نمودند.
